Монастырь и храм Святого Духа были основаны в 1597 г. стараниями Виленского Православного братства.
В 1634 г. на месте старого деревянного был выстроен новый каменный храм с главным престолом в честь Сошествия Святого Духа на апостолов и пределами во имя апостола Иоанна Богослова и св. равноапостольных Константина и Елены.
Храм неоднократно перестраивался в силу разных причин. К 1873 г. принял вид, практически сохранившийся до настоящего времени. Внешний облик храма достаточно прост, а интерьер выполнен в стиле пышного барокко.
Главная святыня, находящаяся в храме — это мощи Виленских мучеников Антония, Иоанна и Евстафия . Эти страстотерпцы, литовцы благородного происхождения, приняли страдания и смерть за Христа при великом князе Альгирдасе в 1347 г.
Спустя 27 лет по кончине Виленские мученики, по благословению Патриарха Константинопольского Филофея, были причислены к лику святых.
Первоначально останки мучеников находились в Николаевском храме, затем в храме Святой Троицы. В XVI в. мощи были перенесены в Свято-Духов монастырь и скрыты в пещере под главным алтарем храма. С 1826 г. были открыты для поклонения и верующие получили свободный доступ к ним.
Накануне I Мировой войны, ввиду угрозы захвата г. Вильнюса немецкими войсками, мощи мучеников были перевезены в г. Москву. Лишь в июле 1946 г. их возвратили в Свято–Духовскую обитель.
Память Виленских мучеников празднуется 27 апреля и 26 июля в день возвращения мощей из г. Москвы.
Архиерейский хор Свято-Духова монастыря регулярно участвует в воскресных и праздничных Богослужениях . В коллективе поет до 30 певчих, среди которых и профессиональные музыканты и певцы-любители. В свое время хором управляли известные хоровые дирижеры: Григорий Ширма, Виктор Ровдо, Всеволод Кубаевский, Алексей Пузаков, Леонид Мурашко.
Богатый репертуар архиерейского хора составляют не только песнопения, основанные на знаменном, киевском, греческом распевах в обработках и гармонизациях А. Кастальского, П. Чеснокова, Д .Соловьева и др. композиторов, но не менее важным для творческого облика хора является классический репертуар, гармонично сочетающийся с акустикой и изящным барочным интерьером собора Свято-Духова монастыря.
Записано в Свято-Духовом монастыре г. Вильнюса 2016 г.